Créée officiellement le 1er mai 2012, l'ANSM est venue remplacer l'ancienne Afssaps, dont elle a repris les missions, les droits et les obligations, mais avec des prérogatives et des exigences renforcées.

Si cette refonte a été effectuée dans le but à restaurer la confiance des citoyens dans les produits de santé, et notamment les médicaments, l'Agence garde toujours les cosmétiques dans son domaine de compétence, sa principale mission dans ce cadre étant d'en garantir l'efficacité, la qualité et le bon usage.

Elle peut à ce titre mener des évaluations, publier des rapports d'évaluation sur la sécurité des produits ou des ingrédients cosmétiques, émettre des recommandations à destination des professionnels ou du grand public, diffuser des alertes et des informations, diligenter des enquêtes, exercer des activités de contrôle en laboratoire, conduire des inspections sur les sites de fabrication et de recherche, travailler en coordination avec les services européens pour faire évoluer la réglementation…

Elle assure également la surveillance des effets indésirables ou inattendus liés à leur utilisation, via le système de la Cosmétovigilance.

Une partie de son site Internet est consacré aux cosmétiques.